Павел Костиков, один из лучших оперов убойного отдела ГУВД Москвы, получает тяжелое ранение во время операции по поимке киллера Палача, а его напарник Дмитрий Смирнов тогда погибает. После лечения Костиков возвращается на службу — но не в убойный, а в информационно-аналитический отдел. Работать в убойном Костиков не может по состоянию здоровья и по прямому указанию генерала Смирнова, отца погибшего напарника. Тот считает Костикова отчасти виноватым в гибели сына. Отношения с новыми коллегами не складываются. Костиков испытывает вину перед вдовой напарника, адвокатом Полиной Смирновой, в которую давно тайно влюблён. Она защищает клиента, обвиняемого в убийстве, и уверена в его невиновности. Костиков проводит неофициальное расследование, в результате которого клиент Полины оказывается оправдан, а настоящий преступник изобличён. После этого Полина всё чаще обращается к Костикову за помощью, и они начинают работать в тандеме, где Костиков становится её «тайным советником».
Корабельный старшина Егор Ермаков возвращается в родной посёлок после шестилетнего отсутствия. Его отец Иван надеется, что сын продолжит вековые традиции семьи, которая занимается сплавом леса и грузов по сибирской реке. В первый же день между Ермаковым и его другом детства Юрой Аникеевым происходит конфликт: пока Егор был в армии, его любимая девушка Лена вышла замуж за Юру. Спустя сутки Аникеев погибает, а все подозрения падают на главного героя. Чтобы оправдаться, Егор начинает собственное расследование и помогает местному следователю разобраться в череде загадочных происшествий. Между бывшими влюблёнными вновь вспыхивают чувства, однако отец Егора против увлечения сына. Вскоре Егор начинает подозревать, что к убийству друга причастны нелегальные золотодобытчики, контролирует которых некий Хозяин. Никто не знает, кто он, как выглядит и как осуществляет контроль над всей криминальной братвой. Егору предстоит вступить в серьёзное противостояние с «золотой» мафией, чтобы спасти свою любовь, узнать, кто на самом деле виновен в гибели Юры и защитить семью от преступников, с которыми вступил в конфликт ещё во время службы на флоте.
Через четыре года после тех жутких событий Финн всё ещё не оправился от произошедшего и периодически слышит звонок телефона, а его сестра Гвен начинает видеть сны, в которых Граббер убивает трёх мальчишек в заснеженном лагере. Также девушка выясняет, что их мать ещё подростком ездила в христианский лагерь, и уговаривает брата отправиться туда. Ребята прибывают на место и из-за сильной метели оказываются отрезанными от внешнего мира, а тем временем сновидения Гвен становятся всё страшнее и всё сильнее проникают в реальность.
Сара и Дэвид не были знакомы до встречи на свадьбе общего друга. Вскоре они отправляются в большое смелое красивое путешествие, в ходе которого им предстоит заново пережить важные моменты из своего прошлого. Это помогает им понять, как они оказались в точке, где находятся сейчас, и, возможно, даст шанс изменить будущее.
Мэри Сью в детстве потеряла отца, и её мать вышла замуж за политика Брэдли Уинера, который борется на выборах за сохранение своего места в сенате. Мэри — проблемная дочь и представляет угрозу для его кампании. Её жизнь состоит из наркотиков, видеоигр и вечеринок, и в результате её выходки часто оказываются в прессе. Однажды Брэдли, посоветовавшись с менеджером избирательной кампании Уэсом, принимает решение устранить девушку, чтобы она не сорвала его шансы на переизбрание. Они нанимают киллера для ликвидации Мэри Сью, надеясь завершить дело до выборов. Однако их планам не суждено сбыться, и падчерица случайно убивает киллера.
Через четыре года после тех жутких событий Финн всё ещё не оправился от произошедшего и периодически слышит звонок телефона, а его сестра Гвен начинает видеть сны, в которых Граббер убивает трёх мальчишек в заснеженном лагере. Также девушка выясняет, что их мать ещё подростком ездила в христианский лагерь, и уговаривает брата отправиться туда. Ребята прибывают на место и из-за сильной метели оказываются отрезанными от внешнего мира, а тем временем сновидения Гвен становятся всё страшнее и всё сильнее проникают в реальность.
Сюжет сериала вращается вокруг трех оперативников - Романа Русакова, Владимира Щукина и Алексея Мухина. В каждой серии «Отдела» оперативники сталкиваются с новыми преступлениями. Чтобы их раскрыть, команде Русакова придется не раз отступать от правил, ведь их методы расследования эффективны, но не всегда законны. Но оперативники готовы пойти на любые жертвы, чтобы не прогибаться перед криминалом, не предавать друзей и дело, которому служат. Сквозной линией через весь сериал проходит история о хитроумном маньяке, который одну за другой убивает девушек легкого поведения. Оперативники бьются над вопросом, почему преступник нападает только на «ночных бабочек» и лишает их жизни при помощи армейского ножа, привезенного из Непала. Разбираясь в этом деле, они пытаются вытащить из СИЗО начальника Ивана Ушанова. Ему грозит тюрьма после того, как он перешел дорогу заместителю начальника ГУВД генералу Александру Харламову.
