- Декорации для съёмок соорудили на ранчо Куалоа на Гавайях, неподалёку от мест, где Колин Треворроу снимал приключенческий фильм «Мир Юрского периода» (2015).
- Второй фильм производства компании Legendary Pictures из серии «Годзилла-Конг».
- В 1976 году Джон Гиллермин снимал ремейк фильма «Кинг-Конг» тоже на Гавайях.
- Джо Корниш отклонил предложение стать режиссёром фильма.
- Джон Си Райли играл доктора Стива Брюле в телевизионном скетч-шоу «Не телевидение, а просто кошмар!» (2007-2010), с любимой фразой персонажа:«Будьте здоровы». В фильме «Конг: Остров черепа» его герой носит куртку с надписью на спине «Полезно для здоровья».
- В работе над сценарием приложил руку Дерек Коннолли.
- Костюм персонажа Джона Гудмана является копией костюма, в котором в оригинальном фильме «Кинг Конг» (Мериан К. Купер и Эрнест Б. Шодсак, 1933) ходил Карл Денхэм в исполнении Роберта Армстронга.
- Название спасательной лодки Gray Fox («Серый Лис») является отсылкой к персонажу из серии видеоигр Metal Gear, адаптацией которой для кино также занят режиссер Джордан Вот-Робертс.
- Дизайн постера к фильму, выпущенный к началу проката в кинотеатрах IMAX, позаимствован у постера к военной драме Фрэнсиса Френсиса Форда Копполы «Апокалипсис сегодня» (1979).
- Для премьеры фильма во Вьетнаме сделали пятиметровую статую Конга, окружённую пламенем расположенных вокруг неё извергающихся вулканов. Через 15 минут пламя «выключили». Никто не пострадал.
- Сэмюэл Л. Джексон впоследствии признался, что во время съёмок никто из актёров не знал, какого роста и каких размеров будет Конг. Авторов фильма об этом неоднократно спрашивали, однако ответы каждый раз были разными.
- Действие фильма происходит в 1973 году, что можно понять в самом начале, когда президент Никсон объявляет об окончании войны во Вьетнаме. Это объявление было сделано в январе 1973 года.
- Вначале производством фильма занимались компании Legendary Pictures и Universal, но в сентябре 2015 года последнюю сменила Warner Bros. Pictures.
Съёмки сцен природы проходили во Вьетнаме.
- Национальное управление Вьетнама по делам туризма предложило режиссёру Джордану Вот-Робертсу пост посланника по вопросам туризма сроком на 3 года.
- Большой поклонник компьютерных игр, а также произведений в жанрах аниме и манга, Режиссёр Джордан Вот-Робертс включил в фильм многочисленные к ним отсылки. Персонаж в исполнении Джона Си Райли, к примеру, носит куртку с надписью «Полезно для здоровья, вредно для образовательного уровня». Куртку с такой же надписью носил Канэда в аниме-фильме «Акира», который Кацухиро Отомо снял по одноимённой манге в 1988 году.
- Китайская актриса Тянь Цзин произносит за весь фильм только 11 реплик.